През януари 1896г. първият концерт на Чешката филхармония е бил дирижиран от Антонин Дворжак. Това е било само началото за един оркестър, който в историята си е записал имената на някои от най-големите диригенти на ХХ век. През 1908г. Густав Малер дирижира премиерата на своята Симфония № 7 в Прага. След Първата световна война Вацлав Талих е основното име, с което се свързват концертите на Филхармонията и той е дирижирал състава 924 пъти! Този факт го прави най-влиятелния маестро в развитието на Чешката филхармония от този период. Следващата ярка фигура, която стъпва на поста главен диригент, макар и за кратко, е Рафаел Кубелик – по време на и след Втората световна война. Но диригентът, който отваря нова страница в развитието на оркестъра, е Карел Анчерл. Той работи с музикантите от 1950г. до размирната за чехите 1968г., след което напуска Чехословакия и емигрира в Канада. Третият период за филхармониците настъпва с идването на маестро Вацлав Нойман – още един продължително задържал се диригент, чиято запазена марка бе стабилността, съчетана с високото ниво на оркестъра и успешното съхраняване на традициите.
Днес Чешката филхармония продължава пътя на един успешен европейски оркестър. 2011г. започна с гостуване на прочутото мецо-сопрано Магдалена Кожена, която представи новата програма „Lettere Amorose” в легендарнта зала на Филхармонията Rudolfinum. Следващите имена в афиша са на гостуващите диригенти Лоурънс Фостър – на 11 и 12 февруари и Myung-Whun Chung на 17 и 18 февруари.